ProNITデータのXMLの更新(2010年08月31日) 詳細....
熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2010年08月31日) 詳細....
ProNITデータの更新(2010年08月31日) 詳細....
PDB構造からProNITエントリーへの直接リンク(2010年08月20日) 詳細....
PDB構造からProThermエントリーへの直接リンク(2010年08月20日) 詳細....
熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2010年08月17日) 詳細....
ProThermデータの更新(2010年08月17日) 詳細....
ProNITデータのXMLの更新(2010年07月26日) 詳細....
熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2010年07月26日) 詳細....
ProNITデータの更新(2010年07月26日) 詳細....
ProNITデータのXMLの更新(2010年06月30日) 詳細....
熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2010年06月30日) 詳細....
ProNITデータの更新(2010年06月30日) 詳細....
熱力学データと構造・配列データのクロスレファレンスの更新(2010年06月29日) 詳細....
ProThermデータの更新(2010年06月29日) 詳細....
九工大では、文科省の統合データベースプロジェクトの一環として、
蛋白質の安定性や相互作用の網羅的な熱力学データと構造データとの統合化を進めています。
統合化として具体的には以下のことを進めています。
1.熱力学情報と構造情報のクロスリファレンスの作成
九工大の熱力学データとPDBjの構造データを対応づけるクロスリファレンステーブルを作成します。
クロスリファレンステーブルを元に、九工大が以前から構築している蛋白質熱力学データベース(ProTherm)、
蛋白質・核酸相互作用データベース(ProNIT)と、PDBjとの間に、双方向にリンクを作成します。
ProTherm: 蛋白質の熱力学データベース
ProNIT: 蛋白質・核酸相互作用データベース
2.オントロジーの整備
熱力学データのオントロジーを整備します。
Controlled Vocabulary for Thermodynamic Databases
3.データ交換フォーマットの整備
XMLなど、熱力学データのデータ交換フォーマットを整備します。
ProThermのXMLデータ
ProNITのXMLデータ(暫定版)
また、ライフサイエンス統合データベースセンターと連携して、
テキストマイニングによる論文の自動収集やデータの自動抽出を実施します。